一個月後，聖旨又到巡撫衙門。旨曰：「官文奏，賊撲江西，湘軍力不能支，請派統兵大員率兵助剿。又奏，已革湖南永州鎮總兵署理湖南提督印務樊燮久歷兵戎，作戰勇猛，當此用人之時，可否仰懇天恩，加恩開復處分率兵援江西等語。著樊燮開復先前處分，率本部馳赴武昌，由官文派用。湖南永州鎮總兵員缺，著周寬世補授。所有湖南提督印務，著周寬世暫行署理。欽此。」
樊燮興高采烈地帶著一應隨員到省依例來向駱秉章辭行。
駱秉章心裡雖是十二分地不滿，但面子上還要和樊燮敷衍。樊燮從籤押房出來，掉頭又進了左宗棠的辦事房。
左宗棠正在案頭忙著處理文牘上的事，樊燮大步闖進門來，有意把地面跺得山響，進門便大聲說道：「左師爺，樊某又來了！」
樊燮聲音洪亮，走路山響，著實把左宗棠嚇了一跳。
左宗棠抬頭一看，見是紅光滿面的樊燮，心裡就一氣，口裡便道：「山人聽人說樊大人要到江西去剿賊？大人可要小心哪。據山人所知，匪酋石達開就在江西，兩次把曾侍郎打進水裡的，可就是他呀！大人此次出征，隨行的物品，可要備齊呀。」
左宗棠話畢，仍然埋首下去忙自己的事情。樊燮反手拉過一把椅子，在左宗棠的對面坐下，說道：「樊某是從槍林彈雨里過來的人，樊某不會紙上談兵，只會沙場用兵。樊某這話講得沒錯吧？」
左宗棠一撇嘴道：「依山人看也不盡然。山人料得不錯的話，有一樣東西，大人本該準備，但卻並未準備。」
樊燮哈哈大笑，問道：「左師爺如此講話，樊某倒要請教一句，左師爺並未到營里去，怎麼就敢肯定樊某此次出征少準備一樣東西呢？別又是左師爺杜撰的吧？」
左宗棠頭也不抬說道：「山人可是話說到了，信不信由你。」
樊燮哈哈笑道：「左師爺，你少在本鎮的面前賣弄你的計謀。本鎮此次來會你，就是要告訴你一句話，你在巡撫衙門為所欲為的日子就快到頭了，你還是早些打點自己的退路吧，不要事情到了眼前才後悔！」
左宗棠用鼻子哼了一聲道：「樊總鎮哪，您知道您此次出征江西，少帶一件什麼東西嗎？」
樊燮笑道：「本鎮此次奉旨到江西剿匪，可謂兵精糧足，本鎮手裡現在缺少的就是匪酋石逆的項上人頭了！」
左宗棠抬頭說道：「總鎮可是大錯特錯了！總鎮此次出征糧少不怕，有官制軍和本師爺為您籌措，當可無虞；兵寡亦不足慮，曾大帥可以撥兩營團勇供您差遣。但您卻不能不帶著棺材！石逆智勇雙全，能把兵用得神出鬼沒。您老此次到江西，不提早把棺材備好，等到身首異處，屬官如何備辦得來呢？江西山林雖多，但能做棺材的木料卻極少，不能不早做準備呀。樊總鎮，您還不明白嗎？」
樊燮一聽這話，嗷地一聲便跳將起來，指著左宗棠的鼻子，大罵道：「你放屁！你敢糟踐朝廷命官，本鎮和你這官司打到底！你給本鎮聽著，本鎮此次奉旨出征，為的就是去取石逆的首級，就算備了棺材，也是為石逆所用！倒是你左師爺，該早早備口棺材才是，說不定哪天有旨下來，你現備都來不及！」樊燮一腳踢翻木椅子，恨恨地走了出去。
左宗棠笑著大聲說道：「樊總鎮走好，恕山人不送！」
樊燮離省不過十幾日，朝廷果然有旨下來。駱秉章接旨之後大驚失色，連連頓足道：「這可如何是好！」
旨曰：「據官文奏，湘陰舉人左宗棠賴湖南巡撫臣駱秉章信任，私自拜發奏稿，擅自給州縣、軍營行文，並依勢欺壓同僚，又利用籌餉之機，在湘潭、湘陰及省城大興土木造屋，致使湖南軍務廢弛，物議沸騰等語。左宗棠累受皇恩，不思報國，著實可恨可惱，著即革職，由駱秉章逐出幕府，派員解交湖廣總督衙門，著官文查明真相，若該員果有不法情事，可就地正法。欽此。」
左宗棠見到聖旨也驚了個目瞪口呆。這是怎麼回事呢？
原來，就在按院衙門到永州辦案不久，樊燮便將收集的幾件左宗棠違制的事例函告了官文。官文依著樊燮所列事項，又添油加醋地渲染了一番，編造了幾件事情，寫成一個參折，遞進了京城。
官文拜折的同時，不忘派人傳信給樊燮，囑其提前起程入鄂，商辦援助江西之事。
駱秉章參樊燮，官文參左宗棠，兩事合一，史稱「參劾樊燮案」。
見駱秉章愁眉苦臉，左宗棠憤然起身道：「撫台大人請放心，古人云：『一人做事一人當。』聖上著官文查辦，山人就一個人到武昌的總督衙門去投案，看官文能把山人怎樣！」
駱秉章擺手道：「季高，你又來了！不是我說你，你到武昌去投案，還想活著出來嗎？官文這個人，一貫心狠手辣，他什麼事做不出來？官文是借著你的事情在和本部院玩手段。好，本部院就陪他玩上一回！樊燮的案子經按院反覆詳查，已經水落石出，我現在就讓潘臬台把案卷送過來，你馬上再起草一份參樊燮的摺子。本部院一會兒給曾侍郎寫封快函通報一下官文誣陷你的事情，讓這個侍郎官替你想個辦法。你呢，也給胡潤芝寫個信過去。潤芝這人手面闊，交際廣，與很多京官都有來往。說不定潤芝一出面，你這場飛來的橫禍就此烏有了呢！」
左宗棠低頭沉吟了一下，說道：「撫台大人容稟，胡潤芝正在任上丁父憂，山人這個時候如何能張得了這個口呢？這不是給他添亂嗎？何況他又與官文住一城，你讓他如何辦理？給潤芝的信，山人不能寫。還有，曾滌生在江西正是焦頭爛額之際，因為厘金的事，他剛參倒巡撫陳啟邁，已是海內嘩然。這個時候，您把山人的事通報給他，您讓他怎麼辦？上折去參官文嗎？山人此次已橫下一條心，所謂是福不是禍，是禍躲不過！山人做過什麼，山人心裡清楚，他官文休想栽贓！」
駱秉章起身道：「好了好了，你不要說這些氣話了。你今晚就把參樊燮的摺子擬出來，別誤了明天一早拜發。其他的事，本部院來辦！」
湖南按察使潘芳很快把有關樊燮一案的卷宗交到左宗棠手上。
左宗棠反覆看了幾遍，提筆便寫了「樊總兵劣跡有據請提省究辦折」十三個大字。摺子先把按院衙門查案經過敘述了一遍，最後寫道：「臣接閱之下，不勝駭異。查該鎮劣跡種種，不但臣前奏違例乘轎，私役弁兵，及攤派養廉、蓋造屋室、家宴戲賞開銷公項等款均屬確鑿有據，且有臣原參所未及者。如兵餉米折皆屬營中正款錢糧，該鎮以專閫大員，輒稱預提廉俸，併購買綢緞，擅行動用，數至盈千，懸項無著；並署中一切使用，復提用營中銀至數千之多。實屬恣意侵虧，大幹功令。且恐此外尚有別項劣跡，即提用之款，亦恐不止此數，亟應徹底追究，按例懲辦，以警官邪。查該鎮已奉旨回楚，此時計早已抵湖北境內。除咨移督臣官文暨署湖北撫臣胡林翼飭查該鎮現行行抵何處，即著委員押解回南，聽候查辦外，相應據實奏參，請旨將永州鎮總兵樊燮拿問，以便提同人證，嚴審究辦，所有遵旨查明各款均有確據緣由，理合恭折具奏。」
摺子拜發，駱秉章笑著對左宗棠說道：「聖諭幾天就能下來，等聖諭到了，總督衙門的官文老賊就得忙著替樊燮在京里找門路，恐怕就顧不上急著催你老弟到案了！」
左宗棠長嘆一口氣道：「山人料得不錯的話，總督衙門催解山人到案的傳文恐怕得搶在聖諭到達前來到湖南。」
駱秉章說道：「給他一個不理也就是了。本部院就不信，他官文還能親自趕來長沙拿人！季高啊，你不要想得太多，曾滌生和胡潤芝會為你想辦法的。自揚州江北大營潰敗後，曾滌生麾下的湘勇愈來愈被上頭看中。此時只要曾滌生肯站出來說句話，朝廷不會把你怎麼樣的。」
左宗棠長嘆了一口氣，默默地走出籤押房。湖廣總督衙門的「速著湖南巡撫衙門委員押解劣幕左宗棠到武昌總督衙門問案」的咨文果然最先到達巡撫衙門。
駱秉章接文在手，也不言語，提筆批了「該員辦理之事尚未交割完畢，一俟交割事竣，定當委員解送」寥寥數語交來人帶回。
曾國藩接到駱秉章的密函後，口裡先是說了一句：「這個左季高，你惹誰不好，怎麼惹上了官文？官文豈是好惹的？」
曾國藩並未急著往京里派人，而是先提筆給駱秉章書信一封，詳詢官文參左的經過並左宗棠是否真有不法情事。信連日交軍營快馬送走。
駱秉章一見到曾國藩的來信，馬上便把左宗棠傳進籤押房，苦笑著說道：「曾滌生給本部院來了一封快函，詢問你老弟是否果有違制不法之事！這個侍郎官，他連你都信不過！」
左宗棠把曾國藩的信默讀了一遍，道：「這就是曾滌生與常人的不同之處，山人佩服的也是他這點。他這是在江西抽不出身子，他若是在省內，當真查清事情根由，他都敢拉上官文去京城找皇上論理！山人活了這麼大，我大清國像曾滌生這樣公私分明的大員，山人還沒有見著！大清國立